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一名國中女生接種人類乳突病毒（HPV）疫苗後，出現關節疼痛症狀，診斷為發生幼年型特發性關節炎，衛福部預防接種受害救濟審議小組認為與疫苗無關，家屬向法院提起行政訴訟，法院判衛福部敗訴。審議小組討論後，5月3日建議衛福部提起上訴。
審議小組召集人、馬偕兒童醫院醫務部主任邱南昌表示，HPV疫苗有很多大規模的實驗，證實跟自體免疫、神經系統疾病「不具相關性」，審議委員找了很多資料，都無法認定相關，雖曾有類似的個案報告，但大數據沒辦法證實，「審議委員也只能說無關」。
關於幼年型特發性關節炎，邱南昌說明，這是自體免疫疾病，發生率約每十萬人口有1.33人，而屬於這種特殊體質的人，不打疫苗仍然會有這種疾病。
邱南昌擔憂：「因為這樣的案例，讓民眾誤認HPV疫苗有危險性，而不去接種疫苗，等到20、30年後罹患癌症，才後悔當初沒有施打。」他指出，國際已有70幾個國家用國家經費提供民眾打HPV疫苗，實證資料都已經證實疫苗有效防範子宮頸癌、陰道癌。
審議小組認為，此判決可能造成未來民眾健康負面影響，幾經權衡仍決定建議衛福部上訴，以維護審議小組獨立專業判斷的公信力，避免民眾對特定疫苗安全產生誤解。
衛福部疾管署副署長莊人祥表示，該署會尊重專家意見，將相關意見整理之後，再提報衛福部，最後會於5月14日前做出最後決定。
