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2019年7月22日，總統蔡英文結束友邦出訪行程搭機返抵國門，卻被爆出特勤人員利用總統專機走私近萬條免稅菸品，華航清查後發表，自2006年以來，總統專機銷售的免稅菸超過4萬條。
國安局清查後發現，76名涉案的國安特勤人員中，國安局有25人、侍衛室49人、憲兵警衛大隊2人，而在國安局25名涉案人員中，分別為局本部4人、特勤中心19人、訓練中心2人。
而在數量上，76名國安特勤人員一共購買7,977條免稅菸，國安局佔2,625條菸、侍衛室4,902條、憲兵警衛大隊450條，國安局局本部4人共買45條（實際購買2人、另2人掛名）、特勤中心19人合計2,430條、訓練中心2人購入150條，其中單人購買最少2條、最多單人一次購入1,037條。
由於社會輿論爭議過大，總統府也公布懲處名單，包括將前侍衛長中將張捷調離現職、並記1大過2小過，副侍衛長少將柳惠千記1大過1小過，兩位警衛主任少將林國欽、少將陳逸夫各1大過，內衛、警情及侍從組熊揚國、楊文津及陳敏華三位上校組長各記1大過處分。
國安局清查後，把近20位參與私菸案的總統維安人員調回國防部任職，並把總統府侍衛室拉回由國安局直接督管；而華航也把資深副總羅雅美、空品處副總邱彰信等5名主管降調為非主管職，包含資深副總、副總經理、協理與兩名組長。
