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臺北市政府以減少移動為原則設立175個疫苗接種站，授權28家醫院、135家基層診所、12個行政區衛生所服務施打民眾；若有剩餘劑量，市長柯文哲也允許診所自行替一至七類對象施打。但臺北市士林區有洗腎中心傳出，因沒有收到公文，竟將剩餘疫苗丟棄作廢。
士林區百齡、福林診所洗腎中心17日均傳出，經造冊向市府衛生局申請足量的疫苗後，疑似因有病患不願意施打、抽取技術不同，最後仍有剩餘劑量，不知如何處理；然而，診所向衛生局及士林區健康服務中心詢問後，皆得到「沒有公文所以不能給其他優先施打對象接種」，因此16日分別將剩餘的2劑、5劑丟棄。
對此，士林區健康服務中心主任呂秀蓉強調，市長近期已明確對外宣布，開封後的疫苗若有剩餘劑量，診所可自行運用給前七類對象施打。洗腎病患不分年齡都可以施打疫苗，診所遇到疫苗剩下的問題，不用公文即可自行運用；但由於洗腎診所並非疫苗接種合約院所，因此不得對外替一般民眾接種，僅能幫洗腎病患或所內工作人員施打。
呂秀蓉表示，士林地區僅有4間洗腎診所，均為非合約診所，必須先造冊給衛生局，經衛生局評估後才會給予確切數量的疫苗，因此理論上來說都可以剛好打完；對於洗腎診所提出質疑，她表示，若有訊息傳遞錯誤的狀況，健康中心會盡快去了解情況，「畢竟疫苗為珍貴資源，大家都不希望會被浪費掉」。
此外，也有民眾向媒體投訴，北部某醫學中心的知名外科女醫師，竟無視暫緩醫事人員同住家人接種的規定，帶著2名同住孩子到院內施打「殘劑」。對此，臺北市長柯文哲於17日下午記者會中表示，倫理比法律重要，外界要對醫師有信心，相信醫師會做合理分配，要相信每個人的善；若將國民當成賊來處理，臺灣就無法成為強盛的國家。◇
