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同屬基督教長老教會的馬偕學校財團法人（馬偕醫學院、馬偕醫護管理專科學校），與真理大學財團法人（真理大學）傳出將合併，形成1法人3校的架構；對此，教育部16日表示，有被洽詢過相關法規，但目前未收到合併計畫書或意向書。
教育部說明，去年12月曾接獲長老教會洽詢2法人合併的法規；不過，教育部目前並未收到2法人的合併計畫書或合作意向書。教育部表示，法人合併和學校合併屬不同類型，馬偕、真理法人合併後形成1法人3校（真理大學、馬偕醫學院、馬偕護專），還不會影響3校各自辦學，包括學制、教師聘任、學生安排等。
在同一學校法人下，董事會是同一批人馬，有利於學校合併，近期傳出將合併的慈濟大學、慈濟科技大學，就是一個例子。不過教育部指出，馬偕、真理法人合併後，如果要進一步推動學校合併，仍要依照《大學法》等規範辦理，私校須經董事會同意，並報教育部核定。
針對馬偕學校法人與真理學校法人擬合併，全國私校工會理事長尤榮輝表示，私校法人合併可統一經營權，有利資源整合運用，重要的是，若其中一校被依《退場條例》公告為專輔學校且改善失敗，可避免董事會被解散，校產被清算歸公。馬偕學校法人及真理學校法人若能合併，至少能確保真理大學校產不會被清算歸公。
但私校法人合併也有相當風險，尤榮輝指出，若以強扶弱失敗，則會互相拖累財務、同歸於盡。若其中一校被《退場條例》14條改組董事會，則原董事會只剩下1/4董事席次，日後在學校停辧時再改選，原董事會有可能會失去所有學校的經營權。
尤榮輝說，法人合併後可進一步思考學校合併，私私併可減少行政管理費，各校財務及系所師資若能整合成一所具有特色的大學，有利招生及學校永續發展。未來慈濟大學及慈濟科大若能合併，在慈濟基金會的支持下，應該能發揮加乘效果，而馬偕醫學院、馬偕護專及真理大學三校背後似無強大財源的支持，未來是否會走向合併仍有待觀察。
