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高端COVID-19（武漢肺炎）疫苗合約近日公開，但有在野黨立委質疑為何通過EUA當天就重新簽訂更嚴格的合約。食藥署長吳秀梅17日表示，審查結果不會主動告知廠商，疾管署也有與會。疾管署補充表示，這是因應緊急疫情需求，國內其它新冠疫苗也都如此，且國際也是相同作法。
高端疫苗採購合約16日公開，但保密協議爭議仍持續，疾管署長莊人祥近日說明，2021年6月8日，高端提出在採購履約過程中會提供許多原物料資訊，擔心涉及國外供應商機密的原物料價格外流，才參酌國際間的疫苗採購合約，事後增補保密條款，強調雙方皆有保密責任，於同年7月19日簽約，期限為5年後解除。
不過，在野黨立委賴士葆在社群媒體發文，質疑高端疫苗7月19日通過「疫苗緊急使用授權書（EUA）」，7月19日就立刻改合約，重新訂了更嚴格的保密合約，「仔細看真是太詭異」。
長吳秀梅17日出席活動後接受媒體聯訪表示，甲乙兩方，也就是買方及賣方有合意制，都是說好的，台灣買了這麼多疫苗都是如此，食藥署在2021年7月18日召開專家會議，依照整個程序進行，會後不會主動告知高端，但廠商能夠詢問疫苗通過結果。
吳秀梅也說，疾管署（CDC）在專家會議的角色是「採購」，也最清楚整個傳染病疫情狀況，是否符合緊急公共衛生事件，食藥署也是依據《藥事法》第48條規定內容，基於緊急公共衛生需求的前提，才進行後續EUA審查。
為此，疾管署17日下午召開臨時記者會，對於高端疫苗尚未完成EUA，就與疾管署完成議價與簽約議題。疾管署副署長羅一鈞表示，這是因應緊急疫情需求，國內其它的新冠疫苗也都如此，國際也是相同作法。
疾管署補充說明，高端公司在6月15日就已提出EUA申請，歷經一個多月食藥署內部整體審查（由醫藥品查驗中心執行）後，於7月18日召開專家會議審查，審核過程均依法定程序辦理。疾管署於一週後召開衛福部「傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）」會議，依據食藥署EUA核准結果決議同意將高端納為公費疫苗，上述過程當時均即時於指揮中心記者會公布，與合約要求的7月31日毫無關聯，請外界勿刻意影射。
