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紅斑狼瘡通過抽血可得知許多免疫檢查的指標，在臨床上頗為實用的，包括抗體與非抗體的指標，也與臨床疾病活動情況密切相關。
自身抗體是人體體內自己產生的抗體，以抗核抗體（ANA）最為重要，其他如抗中性粒細胞胞漿抗體、抗心磷脂抗體等等，參考就好。
抗核抗體（anti-nuclear antibody，ANA）是對抗細胞核，隨著研究不斷深入，ANA已不單針對細胞核，還包括抗核酸(nucleic acid)和核蛋白(nucleoprotein)抗體的總稱。現已有20餘種不同意義的ANA發現，形成抗核抗體譜（ANAs）。
檢測ANA對紅斑狼瘡的診斷與治療十分重要，在系統性紅斑狼瘡病人中，陽性率接近100%，非活動期陽性率也有80%。但是反過來說，ANA滴度高未必就是狼瘡在活動，也不能當作治療的指標，而且缺乏特異性，也就是眾多的免疫疾病都會出現，如膠原性疾病（Collagen Disease）、硬皮病（Scleroderma）、類風濕性關節炎（Rheumatoid Arthritis）、混合性結締組織病（Mixed Connective Tissue Disease）、乾燥綜合症（Sjögren's syndrome）等等都可能出現，所以ANA不能作為診斷紅斑狼瘡的依據，但卻是一個很好的參考指標。
