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國產共肺疫苗收案及試驗進度，引發外界質疑，對此，陳時中1日澄清，自己並不是說BNT、莫德納和牛津AZ等三家疫苗廠只有做第二期試驗，而是當初他們在申請緊急使用授權的時候，只做到完整第二期試驗，後來自己補充有進行三期試驗，並提到，國產疫苗雖希望能成功，但沒辦法保證一定成功，後續仍端看解盲結果及專家會議決定
為說明國內疫苗的收案進度及試驗情形，指揮中心指揮官陳時中在5月31日公開國內三家疫苗廠的二期收案人數，及緊急授權時間，其中，高端、聯亞在二期就收案近4千人，陳時中也提到這個規模比莫德納第二期收案660人還要多，且國際三家廠商都尚未完成三期試驗就獲得各國緊急使用授權(EUA)。
陳時中也在1日指揮中心記者會上表示，自己並不是說BNT、莫德納和牛津AZ等三家疫苗廠只有做第二期試驗，而是當初他們在申請緊急使用授權的時候，只做到完整第二期試驗，但後來我也說這三家都有做到第三期試驗，只是時間就會花比較長。
陳時中提到，自己想說的是，若做完第三期試驗才能核准，就會出現很多困難，像是疫苗上市時間就會延後，另外，他也說，國產疫苗雖希望能成功，但沒有辦法保證一定成功。
對於有人質疑國產疫苗第二期做得不怎麼樣，陳時中說，國產疫苗第二期收案三千多人是有科學證據，但不代表做完第二期試驗後，就非要核准緊急授權使用，一切都還要看解盲結果及專家會議決定。
至於收案人數部分，陳時中則說，每個國家第二期試驗都有不同的收案計畫，國產疫苗也會有另外的二期試驗計畫，只是通過EUA的時候檢附的研究報告，相關文件也提到二期試驗有這樣的收案人數，也已經完成該有的程序，另外，陳時中也說，有些疫苗的第三期試驗也有不同的收案人數，不過在申請EUA當下，第三期試驗其實還沒完成。
陳時中說明，第三期臨床試驗若完成就是循正式藥證的程序，就不是緊急授權輸入製造(EUA)，EUA是因應重大公共衛生事件的權宜措施，過往提到疫苗的申請法規，都會說過於嚴苛、沒彈性，現在依《藥事法》48條之2就能因應緊急公共狀態來發給EUA。
