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衛福部在今年預告修法，增列政府公務預算的其他撥款，列為健保基金財源，遭民團批評，健保基金將逐步變成政府的私人金庫。健保署長石崇良26日回應表示，相關法規調整為的是接軌癌藥基金，為了回應民間期待，規劃獨立於健保外的專款，另待修正辦法上路後，將成立健保基金管理委員會，並邀請專家、病友團體加入。
衛福部今年過年期間，預告修正《全民健康保險基金收支保管及運用辦法》，新增「政府循預算程序之其他撥款」為健保基金來源，並擴大其用途。民團直指，此舉形同帝王條款，不必經由健保會監督，屆時政府撥補財源，可自由指定用途，政府正將健保基金逐步變成政府的私人金庫。
石崇良26日出席活動並在會後受訪表示，法規調整是為了接軌「癌藥基金」，很多民團都希望能有除健保總額外的獨立基金，能夠給付新藥或癌藥，但考量單獨設立基金後，政府無法隨意撥給預算，同時要有法源依據，因此，規劃從現有健保基金的架構進行調整。
經健保署初步評估，未來健保基金將分為「指定用途」及「總額預算」專款兩個區塊，石崇良進一步表示，其中「指定用途」專款，獨立於專款，預算由政府依循公務預算的編納程序編入；「總額預算」也是健保會依據法規進行監督的部分，兩者互相獨立。
石崇良表示，就目前來說，健保總額預算權責為健保會，至於非總額預算的部分，則會由健保署運作，待修正辦法上路後，將成立健保基金管理委員會，並視情況邀請專家或病友團體加入。
