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器質性消化不良是潛在疾病的結果，例如胃炎、消化性潰瘍病（胃或十二指腸潰瘍）或癌症。功能性消化不良（以前稱為非潰瘍性消化不良）是沒有潛在疾病的消化不良。據估計，功能性消化不良影響西方國家約15%的人群，占消化不良病例的大部分。
對於老年患者（60歲以上）或有吞嚥困難、體重減輕或失血等令人擔憂的症狀，建議內視鏡檢查進一步評估並尋找潛在原因。對於60歲以下的患者，建議檢測幽門桿菌，如果呈陽性，則建議對感染進行治療。
消化不良的症狀可能包括上腹部疼痛或不適、腹脹、早飽、餐後飽、嘔吐、噁心、厭食、胃酸反流、噯氣，可能有腹部壓痛，右上腹觸痛或要考慮膽囊炎。
胃腸道的危險信號或警告標誌，包括：慢性消化道出血、進行性無意識體重減輕、進行性吞嚥困難、持續嘔吐、缺鐵性貧血、維生素B12缺乏症（惡性貧血）、上腹部腫塊。這些是較嚴重的腸胃道疾病標誌。
身心和認知因素在評估慢性消化不良時很重要。研究表明，消化不良患者的精神障礙發生率很高，尤其是焦慮和憂鬱。
器質性消化不良包括：
食道炎：食道炎最常見的原因是胃食道逆流，常有胃灼熱感或胸部燒灼感，危險因素包括年齡大於50歲、吸菸、使用止痛藥和肥胖。胃炎：胃炎的常見原因包括消化性潰瘍病、感染或藥物引發。消化性潰瘍最常見的原因是幽門螺桿菌感染或使用止痛藥。胰膽疾病，包括膽石症、慢性胰腺炎和胰腺癌。十二指腸炎症，由於腸道微生物群改變、對食物（主要是麩質蛋白）的反應，或感染引起的十二指腸炎症，可出現消化不良症狀。
功能性消化不良
功能性消化不良是慢性胃灼熱的常見原因。超過70%的人沒有明顯的器質性原因。功能性消化不良分為兩種亞型：上腹痛症候群和餐後窘迫症候群。焦慮也與功能性消化不良有關。
上腹痛症候群為日常生活的胃痛，餐後窘迫症候群為餐後飽腹感或過早飽腹感，都沒有任何器質性疾病的證據。
自限性消化不良可能由於暴飲暴食、吃得太快、吃了高脂食物、在壓力情況下進食，或喝太多酒或咖啡引起的。許多藥物會引起消化不良，包括阿斯匹靈、止痛藥、抗生素、支氣管擴張劑（茶鹼）、糖尿病藥物、抗高血壓藥物、降膽固醇藥物、神經精神藥物、帕金森藥物、減肥藥、類固醇、女性荷爾蒙、強心劑、鐵和鴉片類藥物。小麥和脂肪會導致消化不良，短鏈碳水化合物含量高的食物可能與消化不良有關。這表明減少麩質、低脂肪可改善症狀。此外，有些人在食用某些香料或辛辣食物以及辣椒、巧克力、柑橘和魚等食物時可能會出現消化不良。
全身性疾病
有許多全身性疾病可能產生消化不良，包括冠狀動脈疾病、充血性心力衰竭、糖尿病、甲狀旁腺功能亢進、甲狀腺疾病和慢性腎病。
消化不良若為器質性問題，可對症下藥；如是功能性問題，找不到原因的，可用中藥改善消化功能，如常用的腸胃藥參苓白朮散、香砂六君子湯、肥兒八珍糕等等，或進一步評估，調整全身的氣血陰陽。◇
